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作物杂志2025年第02期:甘蓝型油菜LPAT家族基因鉴定与表达模式分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李坤杰;刘念;丁磊;朱燕;蒙大庆;范其新;李迎春;陈军;

单位:绵阳市农业科学研究院;厅市共建作物特色资源创新及四川省重点实验室;

摘要:溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶(lysophosphatidylcholine acyltransferase,LPAT)在植物脂肪酸的积累和代谢中起着至关重要的作用,为了研究LPAT基因家族在甘蓝型油菜(Brassica napus)中的进化和表达模式,利用生物信息学方法,在甘蓝型油菜全基因组水平进行BnLPAT基因的鉴定,并对其理化性质、系统进化、基因结构、顺式作用元件和表达模式进行分析。结果表明,在甘蓝型油菜全基因组水平一共鉴定到44个LPAT基因,它们不均等分布在17条染色体上。根据系统发育关系分为LPAT1~LPAT5,共5个分支,相邻分支的成员具有相似的基因结构和保守基序构成。在推定的BnLPAT基因启动子区域一共鉴定到4类共42种顺式作用元件。此外,表达模式分析发现它们在不同组织部位均能检测到,进一步检测了12个BnLPAT基因在种子发育过程中以及4个基因在高、中、低含油量材料中的表达特征。

关键词:溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶(LPAT);;甘蓝型油菜;;基因家族鉴定;;表达模式

基金资助:四川省重大科技专项(2022ZDZX0015);; 四川省创新团队项目(sccxtd-2023-03);; 国家油菜产业技术体系建设项目(CARS-12);; 重庆市技术创新与应用发展专项(cstc2021jscx-cylhX0003);; 四川省“十四五”育种攻关项目(2021YFYZ0018);; 四川省“天府菜油”行动奖补项目(2023TFRO06)