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作物杂志2025年第02期:大麦典型硫氧还蛋白(TRX)基因家族鉴定与生物信息学分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈虎;高原;孙家猛;俞鹏;肖洪武;张海涛;

单位:安徽农业大学农学院;

摘要:在栽培大麦MOREX全基因组水平下,利用TBtools、ExPASy、BUSCA、MEME、PlantCARE等在线工具对其染色体定位、理化性质、基因结构、保守结构域和启动子进行了预测分析。利用已发表的RNA-seq数据分析了典型TRX基因家族成员在大麦不同时期、不同组织部位的表达模式及其在干旱胁迫下的表达谱。结果表明,大麦典型TRX基因家族有15个成员,不均匀地分布在6条染色体上(除6H染色体)。启动子顺式作用元件预测到大麦典型TRX基因家族在生长发育、激素调控、非生物胁迫方面均发挥功能。15个典型TRX基因在种子、根、茎、叶和花等不同组织和不同时期均有表达。

关键词:大麦;;TRX基因家族;;系统进化;;表达分析;;生物信息学

基金资助:“十四五”国家重点研发计划(2022YFF1002903);; 国家自然科学基金(31871603)