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作物杂志2025年第01期:高粱Dof基因家族鉴定及表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:付森杰;宋迎辉;朱灿灿;叶珍言;秦娜;代书桃;刘海霞;王春义;李君霞;

单位:河南省农业科学院粮食作物研究所;长葛市农业农村局;

摘要:DNA结合单锌指蛋白(DNA binding with one finger,Dof)是植物中特有的一类转录因子,参与调控植物组织分化、种子萌发、植物抗逆及代谢等生理生化过程。为鉴定并分析高粱Dof转录因子家族成员,利用生物信息学方法从全基因组水平对高粱Dof转录因子家族成员的基本基因结构、理化性质、保守基序、启动子顺式作用元件、组织特异性表达及干旱胁迫表达等进行分析。20%PEG6000模拟干旱胁迫处理豫粱10号的幼苗后,利用qPCR技术分析Dof基因家族成员响应不同时间段干旱胁迫的表达情况。结果共鉴定了30个高粱Dof基因,分布在9条染色体上,基因保守性分析结果显示,Motif1(即锌指结构)是高粱Dof基因家族中保守的蛋白质序列;其中29个基因中都含有CX2CX21CX2C保守基序,而SbDof15基因保守序列为CX20CX2C;启动子结构分析表明,Dof基因的启动子区域中含有ABA、MYB、MeJA、低温等逆境胁迫响应元件;进化树分析结果表明,高粱Dof蛋白与玉米的同源性更高,热图分析表明Dof家族成员在高粱的不同部位都有表达。qRT-PCR结果表明,高粱Dof基因家族成员可能参与高粱应对干旱胁迫的响应,不同的Dof基因成员在应对干旱胁迫时的调控机制可能不一样。

关键词:高粱;;Dof基因家族;;转录因子;;全基因组鉴定;;PEG处理

基金资助:中央引导地方科技发展资金(Z20221341070);; 河南省农业科学院自主创新项目(2023ZC014);; 农业农村部/财政部现代农业产业技术体系专项资金项目(nycytx-CARS-06);; 河南省良种联合攻关项目(2022010401);; 河南省农业科学院创新团队专项(2023TD036)