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烟草科技2024年第01期:基于宏基因组的烟田土壤细菌群落结构和功能分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:申晓晴;高华军;拓阳阳;耿召良;蔡斌;李红丽;王岩;

单位:郑州大学生态与环境学院;中国烟草总公司海南省公司海口雪茄研究所;四川省烟草公司凉山州公司德昌分公司;

摘要:为探讨健康和易感病烟田土壤微生物群落结构及其功能,以凉山彝族自治州连作10年的1块健康和2块易感病(黑胫病、青枯病和根腐病)烟田为研究对象,利用宏基因组技术分析土壤细菌群落结构。结果表明:健康和易感病烟田的土壤细菌群落结构具有明显差异。烟田土壤中相对丰度大于4%的优势菌门有放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)和绿弯菌门(Chloroflexi)。健康烟田土壤中优势有益菌属链霉菌属(Streptomyces)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和分枝杆菌属(Mycobacterium)的相对丰度极显著高于易感病烟田。易感病烟田土壤中潜在病原菌罗思河小杆菌属(Rhodanobacter)的相对丰度极显著高于健康烟田。健康烟田土壤中蛋白酶活性显著高于易感病烟田。健康烟田土壤中碳代谢途径的关键酶基因丰度均高于易感病烟田;氮代谢途径中,健康烟田反硝化过程的酶基因丰度低于易感病烟田。因此,健康和易感病烟田土壤中细菌群落组成、酶活性及碳氮代谢过程中的关键酶基因丰度均存在不同程度的差异。

关键词:宏基因组;细菌群落;代谢通路;碳氮代谢;酶活性

基金资助:中国烟草总公司海南省公司“不同农艺措施对海南雪茄烟田土壤健康影响及调控技术研究”(2021460000240131); 四川省烟草公司科技项目“凉山州烟田健康土壤微生物特征、绿色调控技术及其推广”(LSYC201803)