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基因组学与应用生物学2024年第04期:马铃薯GRF基因家族的鉴定和表达模式分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:石蒙蒙;王德颖;谢浩杰;秦志广;刘紫婕;韩宝佳;呼雨君;郭文慧;孙永旺;

单位:聊城大学农学与农业工程学院;

摘要:生长调节因子(growth-regulating factor, GRF)家族基因编码植物特有的转录因子,在植物生长发育和胁迫响应等许多生物学过程中发挥重要调节作用。本研究利用生物信息学方法全面鉴定了马铃薯(Solanum tuberosum)GRF基因家族,并分析了其表达模式。在马铃薯基因组中共发现了12个GRF家族基因(StGRF1~StGRF12),其编码的蛋白均含有QLQ结构域和WRC结构域;StGRF基因分布在马铃薯的9条染色体上,染色体片段复制可能导致了该家族基因在马铃薯基因组中的扩张;系统进化分析显示,StGRF可以分为5组,同组的基因成员具有相似的基因结构,且其编码的蛋白具有相似的保守结构域分布;StGRF成员启动子区域存在丰富的激素和胁迫响应相关元件;表达模式分析显示,StGRF在马铃薯不同发育时期及各个组织中呈现出多样化的表达特征,这说明不同成员可能在马铃薯生长发育过程中发挥特异的调控作用。以上结果可为进一步探索StGRF的功能提供一定基础。

关键词:马铃薯;生长调节因子;基因家族;生物信息学;表达模式

基金资助:国家自然科学基金项目(32101788); 聊城大学博士科研启动基金项目(318052021);聊城大学大学生创新创业训练计划项目(S202110447009;CXCY2022338)共同资助