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基因组学与应用生物学2024年第05期:西藏沙棘和肋果沙棘叶绿体基因组比较分析及系统发育研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李昕娟;刘丽娥;李鸿燕;李嘉欣;周武;

单位:青海大学生态环境工程学院;

摘要:沙棘属(Hippophae)植物具有丰富的经济价值和生态价值,但对于沙棘属植物的分类和系统发育研究还存在不足和争论。本研究基于西藏沙棘(Hippophae tibetana)和肋果沙棘(Hippophae neurocarpa)的叶绿体基因组进行分析和研究,以探究沙棘属植物在系统发育和分类上的关系。组装后得到的西藏沙棘和肋果沙棘的叶绿体基因组大小分别为155 810 bp和156 316 bp,二者(G+C)含量相差仅0.02%;经注释后得到的西藏沙棘叶绿体基因组含有131个基因,肋果沙棘叶绿体基因组含有132个基因;二者分别含有246个和247个简单重复序列,41个和36个长重复序列。在对沙棘属叶绿体基因组进行分析后得出6个高可变区,可用于系统发育分析以及分子标记的开发。由系统发育结果可知,西藏沙棘单独为一支,肋果沙棘则与蒙古沙棘(Hippophae rhamnoides subsp.monglica)等沙棘属亚种聚为一支。本研究可为沙棘属植物的分类和系统发育研究奠定基础。

关键词:西藏沙棘;肋果沙棘;叶绿体基因组;系统发育分析

基金资助:国家自然科学基金地区科学基金项目(32160386)资助