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基因组学与应用生物学2024年第05期:土库曼蝗线粒体基因组特征及其系统发育分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:马钰洁;兰世强;蒲雪;季荣;袁亮;

单位:新疆师范大学生命科学学院,中亚区域跨境有害生物联合控制国际联合研究中心;新疆师范大学生命科学学院,新疆特殊环境物种保护与调控生物学实验室;新疆师范大学生命科学学院,新疆特殊环境物种多样性应用与调控重点实验室;

摘要:土库曼蝗(Ramburiella turcomana)是新疆草原常见的危害蝗虫。本研究基于二代测序技术获得土库曼蝗线粒体全基因组序列,并对其进行注释及特征分析。采用近邻相接法(neighbor joining method, NJ)和贝叶斯法(bayesian inference method, BI)构建网翅蝗科(Arcypteridae)系统发育树。结果表明,土库曼蝗线粒体基因为双链环状DNA,全长15 670 bp,具有明显AT偏好(72.21%),共编码37个基因,包括13个蛋白编码基因、 22个tRNA编码基因、 2个rRNA编码基因,以及1个非编码控制区域(D-loop区)。土库曼蝗线粒体基因组发生了蝗亚目(Locustodea)普遍存在的DK重排(DK rearrangement)现象。基于网翅蝗科已报道物种线粒体全基因组构建的NJ树和BI树具有相同的拓扑结构,其中土库曼蝗与16种网翅蝗亚科(Arcypterinae)蝗虫聚为一支,并位于网翅蝗亚科最基部,其余6种竹蝗亚科(Ceracrinae)蝗虫聚为一支,暗示土库曼蝗是网翅蝗亚科中较古老的物种。本研究公布的土库曼蝗线粒体全基因组为土库曼蝗属(Ramburiella)中首次报道,为挖掘土库曼蝗属其他物种线粒体全基因组提供了分子生物学参考。

关键词:网翅蝗科;土库曼蝗;线粒体基因组;系统发育分析

基金资助:国家自然科学基金项目(32260130)资助