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作者:陈晴晴;吴小珉;陆皖行;储娜;李嘉琪;龚磊;孙永;
单位:安徽省疾病预防控制中心;
摘要:目的 分析安徽省滁州市和安庆市2021—2023年分离获得的发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)全基因组序列特征,为发热伴血小板减少综合征(SFTS)防控提供科学依据。方法 选取2021—2023年安徽省滁州、安庆市分离的SFTSV毒株共55株进行全基因组序列测序,采用MEGA 7.01、DNASTAR 7.1和RDP 4.101等软件对获取的SFTSV的L、M、S片段序列进行比对分型、相似性分析、基因重组分析和进化压力分析等。结果 55株SFTSV毒株分为A、C、E和F四种基因型,3种重配型。滁州市和安庆市主要流行基因型分别为A和F型。55株SFTSV的L、M、S片段核苷酸序列相似性分别为95.40%~100.00%、93.40%~99.90%和94.20%~100.00%;RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)、糖蛋白前体(GP)、核蛋白(NP)和非结构蛋白(NSs)氨基酸序列相似性分别为99.20%~100.00%、97.30%~100.00%、98.80%~100.00%和96.60%~100.00%。3株SFTSV毒株的S序列存在基因重组现象。55株SFTSV毒株的RdRp、GP、NP和NSs的非同义替换率与同义替换率的比值(dN/dS)分别为0.05、0.14、0.03和0.13。结论 安徽省滁州市和安庆市SFTSV毒株存在多种基因型并流行的情况,应加强SFTS病例的病原学监测工作,为安徽省SFTS防控工作提供研究基础。
关键词:发热伴血小板减少综合征病毒;;大别班达病毒;;全基因组;;基因型
基金资助:2022年度安徽省卫生健康科研项目(No.AHWJ2022b016,No.AHWJ2022b030)~~