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作者：张恩民;张慧娟;贺金荣;李伟;魏建春;
单位：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室;
摘要：目的 分析中国炭疽芽胞杆菌基因型多态性，掌握中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征。方法 收集中国20个省份的炭疽芽胞杆菌菌株，采用经典单核苷酸多态性（canSNP）和多位点可变数目串联重复序列分析（MLVA）进行基因型鉴定，分析不同分离来源菌株基因型的分布特征；采用Bionumerics 5.1软件进行聚类分析，并计算各位点的Simpson指数。结果 533株中国炭疽芽胞杆菌均属于全球炭疽菌基因谱系中的A群，并具有全球12种亚群中的6种亚群，分别为A.Br.001/00 2、A.Br.Ames、A.Br.Aust94、A.Br.008/009、A.Br.Vollum和A.Br.005/006，其中A.Br.001/002亚群（60.98%）是中国的主要流行谱系，各地区均有分布，A.Br.Aust94(14.26%)、A.Br.008/009(11.82%)和A.Br.Vollum(4.69%)3个亚群主要分离自1980和1990年代的新疆维吾尔自治区（新疆），A.Br.Ames亚群菌株主要来自内蒙古自治区，主要分离自2010年代，A.Br.005/006亚群菌株最少，分离自2019年后。canSNP亚群在中国的地理分布不均衡，新疆、广西壮族自治区、青海省、内蒙古自治区、河北省等具有4～5种亚群，而四川省等10省仅有1种亚群，新疆以A.Br.Aust94和A.Br.008/009为优势亚群，其他地区均以A.Br.001/002为优势亚群。不同分离年代菌株的亚群分布有差异，在以A.Br.001/002为主要流行亚群的基础上，1980和1990年代A.Br.008/009、A.Br.Vollum和A.Br.Aust94相继出现并流行传播，2000年后A.Br.Ames亚群逐渐传播扩散，2019年A.Br.005/006亚群被检测到，显示了炭疽菌株基因型的传播和变异趋势。通过MLVA15分型研究菌株具有91个基因型，结果与canSNP亚群基本一致，且各亚群内MLVA15的分型能力均较好。结论 本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌canSNP和MLVA基因型数据库，掌握了中国炭疽杆菌基因型分布特征及其传播扩散趋势，为炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。
关键词：炭疽芽胞杆菌;;基因分型;;经典单核苷酸多态性;;多位点可变数目串联重复序列分析;;遗传特征;;中国
基金资助：国家重点研发计划（No.2023YFC2605601;No.2022YFC2305304）~~
