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作者：李浩;栾阳;夏茹意;赵贺;
单位：西安市疾病预防控制中心微生物与生物检验科;西安交通大学医学部公共卫生学院流行病与统计学系;
摘要：目的 分析2021—2023年陕西省西安市非伤寒沙门菌的分子分型和耐药基因携带情况，了解其种群结构和耐药基因分布，为制定针对性的沙门菌防控策略提供科学依据。方法 利用MGISEQ-200测序平台对非伤寒沙门菌进行全基因组测序，拼接完成后利用EntroBase提供的核心基因组多位点序列分型（cgMLST）的方案构建全基因组等位基因最小生成树，利用ResFinder 4.2.0软件进行耐药基因鉴定。结果 96株非伤寒沙门菌共分为17个HCC50型别，其中HCC50＿1～HCC50＿4为主要流行型别。9株HCC50＿3型沙门菌均为2021年所分离，等位基因差异数均<10个，参考流行病学资料，可能有共同来源。HCC50＿1型别内部，2个单克隆子型别HCC5＿1和HCC5＿2在2022和2023年均有检出，显示这2个单克隆株在本地流行。HCC50＿2和HCC50＿4可以分为25个HCC5型别，呈散发。耐药基因方面，96株非伤寒沙门菌β-内酰胺类耐药基因bla TEM-1、氨基糖苷类耐药基因aph(3')-Ib和aph(6)-Id总携带率均为80.21%(77/96)，四环素类耐药基因tet(A)、tet(B)和tet(M)总携带率为69.79%(67/96)，磺胺类抗生素耐药基因sul2基因总携带率为73.96%(71/96)。结论 全基因组cgMLST分型分辨率高，可以多层次地描述沙门菌种群结构，鉴定散在暴发克隆，是流行病学溯源的重要工具。西安市非伤寒沙门菌存在优势流行克隆群，且普遍携带多种耐药基因，表现出多重耐药趋势，应加强耐药监测和管理。
关键词：非伤寒沙门菌;;分子分型;;耐药基因
基金资助：陕西省自然科学基础研究项目（No.2022JQ-768）;; 西安市卫生健康委员会科研项目（No.2024yb26）~~
