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疾病监测2024年第06期:2017-2022年北京市某区GⅡ.2[P16]型诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王彦波;赵宇;何牧;杨艳辉;李湛;张赫;贾楠;靖灯节;刘盛田;彭涛;荆红波;靳淼;

单位:北京市顺义区疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;

摘要:目的 了解2017—2022年北京市某区GⅡ.2[P16]诺如病毒感染疫情的分子流行特征。方法 收集2017年1月至2022年12月北京市某区诺如病毒相关疫情信息及样本,应用实时荧光聚合酶链式反应(PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过逆转录PCR扩增、测序和序列分析;并获得2022年诺如病毒的3株GⅡ.2[P16]全基因组序列。结果 2017年1月至2022年12月,共报告诺如病毒暴发137起,83起成功获得基因分型,其中GⅡ.2[P16]占35.04%(48/137),为主要基因型,其季节高峰在冬春季,主要发生在托幼机构和小学。根据基因组进化结果分析,本研究2022年3株GⅡ.2[P16]基因组在VP1与GⅡ.2[P16]亚群(2019—2022)同属一簇;RdRp区与GⅡ.2[P16]亚群(2018—2022)同属一簇。在非结构蛋白P48出现3个氨基酸变异,包括P44S、M163 T和V227I,在RdRp区出现一个氨基酸位点变异,为S1645C。结论 GⅡ.2[P16]是2017年1月至2022年12月引起北京市某区诺如病毒疫情的优势流行株,持续监测和基因组分析有助于全面了解流行株变异和进化机制。

关键词:诺如病毒;;GⅡ.2[P16];;全基因序列

基金资助:北京市顺义区卫生健康发展科研专项(No.Wsjkfzkyzx-2023-y-04);; 北京市高层次公共卫生技术人才建设项目学科骨干培养项目(No.01-026)~~