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作者：强强;畅引东;孙瑛健;贾仡伟;张作刚;
单位：山西农业大学植物保护学院;
摘要：【目的】探究玉米大斑病菌(Exserohilum turcicum)基因组简单重复序列(SSR)位点信息特征，并筛选和验证其多态性引物，为后续玉米大斑病菌遗传多样性分析及遗传图谱的构建奠定基础。【方法】利用MISA软件对已有玉米大斑病菌基因组序列进行SSR位点检索；采用Primer 3.0设计SSR引物，通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳对SSR多态性引物进行筛选和验证。【结果】在玉米大斑病菌30条染色体基因组中共搜索到12 046个SSR位点，SSR位点平均密度为276.9个·Mb~(-1)。其中：三核苷酸重复型SSR最多，占总SSR数量的31.38%;五核苷酸重复型SSR最少，占总SSR数量的2.10%。全基因组中共检测到203种碱基重复类型，其中，C/G重复类型最多，SSR位点数量为2 299个，占比19.09%, AC/GT次之(1 669个，占比13.86%)。SSR位点的重复次数主要集中在5～16次，占总SSR数量的91.38%;重复10次的SSR位点数量最多，占总SSR数量的18.40%;SSR长度范围为10～300 bp,其中，10～20 bp占比最多，占总SSR数量的72.12%。通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，从78对引物中筛选出25对扩增性好且多态性高的SSR引物。【结论】玉米大斑病菌基因组含有丰富的SSR位点，具有开发多态性SSR引物的潜力；筛选的25对扩增性好且多态性高的SSR引物可用于后续玉米大斑病菌的鉴定、遗传多样性分析及遗传图谱构建等。
关键词：玉米大斑病菌;;基因组;;简单重复序列;;分子标记;;多态性引物
基金资助：山西省种业发展中心专项(2022QT011、2023QT039)
