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作者：王一涵;张宏莉;张慧;马俊蕊;项勋;段纲;常华;
单位：云南农业大学动物医学院;
摘要：【目的】探究红嘴鸥(Larus ridibundus)干扰素调节因子7(interferon regulatory factor 7,IRF7)基因的相关信息，为研究IRF7蛋白在抗病毒反应中的功能提供依据。【方法】克隆IRF7基因，运用MegAlign工具和MEGA 11.0软件分析其序列，运用Rare Codon Caltor工具、ProtParam工具、NetNGlyc 1.0工具、NetPhos 3.1工具、TMHMM 2.0工具、SignalP 4.1工具、ProtScale工具、PSORT Prediction软件、SOPMA和SWISS-MODEL软件分析其编码蛋白的稀有密码子特征、理化性质、N-糖基化位点、磷酸化位点、跨膜区域、信号肽、亲水性、疏水性、亚细胞定位、二级结构和三级结构。【结果】红嘴鸥与三趾鸥(Rissa tridactyla)亲缘关系最近，IRF7基因长度为1 242 bp, IRF7是亲水性蛋白，不属于跨膜蛋白或分泌蛋白，其分子质量约为46 ku,主要存在于细胞核，无信号肽和跨膜结构域。IRF7二级结构主要由无规则卷曲构成，其三级结构与翻石鹬(Arenaria interpres)IRF7蛋白(模型蛋白)的相似性为78.73%。【结论】IRF7基因的保守性较差。
关键词：红嘴鸥;;干扰素调节因子7;;克隆;;生物信息学分析;;病毒防御
基金资助：云南省重大科技专项(202302AA310020、202202AE090024);; 云南农业大学教育教学改革研究类项目(YNAUKCSZJG2023009);云南农业大学第二批校级一流本科课程(2021YLKC017);云南农业大学第四批校级一流本科课程(A1010103001)
