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山东农业科学2025年第07期:高粱GAox基因家族的鉴定及其在种子萌发中的表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:姜昱雯;任艳;陈满静;赵强;张国兵;沈佳奇;高旭;邵明波;

单位:贵州省旱粮研究所;

摘要:GAox家族是赤霉素合成途径的关键酶。本研究对高粱(Sorghum bicolor L.)GAox家族基因进行了鉴定和生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对GAox基因在高粱种子萌发过程中的表达进行了验证。结果表明,从高粱基因组中共鉴定出16个GAox基因家族成员,不均匀地分布在6条染色体上,编码323~498个氨基酸。这些GAox蛋白的等电点在4.80~9.58之间,不稳定指数和脂肪系数分别在36.17~54.87和69.29~90.81之间,均为亲水性蛋白且定位于细胞质。通过系统进化分析可将高粱GAox家族成员分成GA20ox、GA3ox、C20GA2ox、C19GA2ox四个亚族,分别包含4、2、3、7个成员。对高粱GAox基因进行组内和组间共线性分析发现,高粱GAox基因家族中有5对片段重复基因,高粱与水稻GAox基因家族之间有29对共线性基因。对高粱GAox基因家族成员的基因结构与保守基序分析结果显示,高粱GAox基因包含1~4个外显子,0~3个内含子,15个保守基序。顺式作用元件分析表明,高粱GAox基因家族成员均含有脱落酸响应元件、茉莉酸甲酯响应元件、光响应元件,推测其功能与植物的生长发育、光反应和植物激素等有关。表达模式分析结果显示GAox基因的表达具有组织特异性,表明其在高粱生长发育过程中有着不同功能。qRT-PCR分析结果表明,这16个高粱GAox基因在种子萌发过程中可上调表达,但表达量峰值出现时间不同,这种差异化表达暗示不同的GAox基因可能在高粱种子萌发的不同阶段发生作用。本研究结果可为高粱GAox基因的功能研究提供理论依据。

关键词:高粱;;GAox基因家族;;生物信息学分析;;种子萌发;;表达模式

基金资助:贵州省农业科学院青年科技基金项目(黔农科一般基金[2025]21号,黔农科一般基金[2024]09号);; 贵州省特色杂粮生物育种全省重点实验室项目(黔科合平台ZSYS[2025]026);; 贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK[2023]一般169);; 中央引导地方科技发展基金项目(黔科中引地[2022]4045);; 遵义市科技与大数据、茅台学院市校联合科技合作资金项目(遵义市科合HZ字[2024]373号)