来源：期刊VIP网 时间：
作者：王莉娟;曹伟;王小强;杨舒慧;李强;
单位：四川省畜牧总站;
摘要：为准确评估川中黑山羊的保种效果，使用山羊65K SNP芯片对307只川中黑山羊（25只公羊，282只母羊）进行了单核苷酸多态性（SNP）测定，采用Plink(V1.90）软件计算群体的多态性标记比例、期望杂合度、观测杂合度，SNe P(V1.1）软件计算有效群体含量；采用Plink软件构建状态同源（IBS）距离矩阵，GCTA(V1.94）软件构建基因组亲缘关系矩阵（G矩阵）；采用Mega X(V10.0）分析了川中黑山羊保种群的家系结构；采用Plink软件计算每个样本的连续性纯合片段（ROH）的个数和长度，并计算基于ROH的近交系数。结果表明，川中黑山羊保种群体的有效群体含量（Ne）为43.700，多态标记比例（P_N）为0.884；多态信息含量（PIC）、最小等位基因频率（MAF）分别为0.268、0.275；观察杂合度（Ho）、期望杂合度（He）分别为0.369、0.372；群体平均遗传距离为0.295 4±0.012 5，基于ROH的平均近交系数F_(ROH)为0.049±0.041，保种群体公羊可划分为12个家系，以满足保种场至少6个血缘的数量要求。综上所述，川中黑山羊保种群体遗传多样性丰富，近交程度低，保种效果良好。
关键词：川中黑山羊;;SNP芯片;;保种效果;;遗传多样性;;遗传结构
基金资助：四川省“天府青城计划”天府农业大师项目（川青城第944号）;; 现代农业产业技术体系四川肉羊创新团队（SCCXTD-2024-14）
