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淡水渔业2025年第02期:基于COI基因的黄河河南-山东段鲤群体遗传结构分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:薛向平;孙朝徽;刘霞;惠筠;李学军;李秀启;司飞;

单位:河北省渤海鱼类种质资源保护与利用重点实验室,中国水产科学研究院北戴河中心实验站;中国水产科学研究院渤海渔业研究中心;河南省水产科学研究院;河南师范大学;山东省淡水渔业研究院;

摘要:为了解黄河河南-山东段黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus)野生和养殖群体的种质资源现状,本研究基于线粒体COI基因序列,对黄河河南-山东段的6个野生和2个养殖群体,共计204尾黄河鲤样本进行了遗传多样性分析。研究结果表明,204条长度为628 bp的COI基因序列中,碱基A、T、C和G的平均含量分别为26.74%、27.41%、28.01%和17.84%,A+T的含量(54.15%)高于C+G的含量(45.85%),表现出明显的AT偏倚性。8个黄河鲤群体共检测到18个多态位点,定义了17个单倍型,Hap2、Hap4和Hap5出现频次最高,其中Hap4和Hap5为8个黄河鲤群体共有单倍型,分布于133个样本中,占总样本数的65.20%。核苷酸多样性(P_i)为0.000 97~0.002 54,单倍型多样性(H_d)为0.451~0.837,遗传多样性水平总体偏低,表现出高H_d低P_i。山东东阿(DE)群体的遗传多样性最高,其次为河南三门峡(SMX)群体、河南恼里(NL)群体,最低为河南养殖群体(HNYZ)群体。群体间Fst及遗传距离结果显示,黄河口(HHK)群体与其他群体间存在一定程度遗传分化,但不显著,HHK和DE群体的遗传距离最大,河南段柳园口(LYK)群体和河南养殖(HNYZ)群体的遗传距离最小;8个群体的分子方差分析(AMOVA)显示,变异主要来源于群体内,占总变异86.04%;中性检验和碱基错配分布结果分析表明,黄河鲤群体历史上可能经历过扩张或持续增长,当在环境、捕捞等外部压力减小的情况下种群可能实现快速补充,这为当前种群资源量匮乏形势下黄河鲤的种群资源恢复提供了良好信号。

关键词:黄河鲤(Cyprinus carpio haematopterus);;线粒体COI基因;;遗传多样性;;群体遗传进化

基金资助:农业农村部财政专项“黄河渔业资源与环境调查”