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作者:贾敏;邓庆梅;王惠芬;万晓枫;王宏志;杨武林;
单位:安徽理工大学医学院;中国科学院合肥物质科学研究院健康与医学技术研究所;中国科学院合肥肿瘤医院医学病理中心;
摘要:目的 探讨基质金属蛋白酶12(MMP12)作为泛癌标志物的特征,评估其作为肿瘤血清标志物的筛查价值。方法 利用GEPIA2、GSCA和cBioPortal等生物信息工具对TCGA泛癌症数据集进行MMP12泛癌特征分析,包括MMP12 mRNA基因差异表达分析、预后分析、DNA甲基化分析、基因结构变异分析及免疫微环境分析。进一步收集肺腺癌、乳腺癌、食管鳞癌、胃癌、肝细胞癌及健康人群血清,ELISA检测血清中MMP12的表达,ROC曲线下面积评估MMP12的筛查效能。随访食管鳞癌患者28例,比较19例疾病进展组和9例稳定组间MMP12血清水平。结果 泛癌特征分析显示,MMP12 mRNA的表达与其启动子DNA甲基化呈负相关关系(P<0.05),与基因拷贝数变异呈正相关关系(P<0.05)。与癌旁正常组织相比,MMP12 mRNA在14种癌组织中的表达上调(P<0.05),并且与癌症患者的预后不良相关(P<0.05)。免疫相关分析显示,MMP12与免疫、基质细胞的浸润、肿瘤突变负荷(TMB)及微卫星不稳定性(MSI)显著相关(P<0.05)。ROC曲线分析显示,MMP12可作为筛查肺腺癌、乳腺癌、食管鳞癌、胃癌及肝细胞癌的潜在生物标志物。食管鳞癌为期30个月的随访发现,疾病进展组MMP12的表达高于稳定组。结论 MMP12是一种潜在的泛癌筛查和预后标志物。
关键词:MMP12;;泛癌症;;血清;;筛查;;预后;;标志物
基金资助:国家自然科学基金项目(编号:81872276);; 安徽省卫生健康科研项目(编号:AHWJ2021b142)~~