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茶叶科学2025年第06期:柚和茶树上柑橘始叶螨线粒体基因组特征及叶螨科系统发育分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈世春;江宏燕;廖姝然;陈亭旭;王晓庆;

单位:重庆市农业科学院茶叶研究所;

摘要:柑橘始叶螨(Eotetranychus kankitus Ehara)是一种危害多种作物的农业害螨,开展线粒体基因组的测定分析可明确其线粒体基因组结构特点,以及叶螨科物种的系统发育关系。通过PCR扩增、测序、组装和注释后获得柚和茶树上柑橘始叶螨的线粒体基因组序列,利用最大似然法和贝叶斯法构建了基于13个蛋白质编码基因(Protein coding gene,PCG)和2个核糖体RNA(Ribosomal RNA,rRNA)基因序列的叶螨科系统发育树。结果显示,柚和茶树上的柑橘始叶螨线粒体基因组大小均为13 032 bp,GenBank登录号分别为OQ955767和OQ955768,均包括13个PCG、2个rRNA基因、22个转运RNA(Transfer RNA,tRNA)基因和1个40 bp的控制区,基因排列完全一致,序列相似率较高,全基因组和各区域的碱基组成数值均较为接近。系统发育和遗传距离分析显示,两种寄主上的柑橘始叶螨在系统发育树上聚为一枝,两者之间遗传距离为0.068 0,远小于各自与叶螨科内其他物种之间的遗传距离。柑橘始叶螨在遗传距离和系统发育树上均与全爪螨属(Panonychus)物种存在较近的亲缘关系。研究通过线粒体基因组分析明确了柚和茶树上的柑橘始叶螨分化程度较低,寄主间转移风险较高,建议已有柑橘始叶螨发生以及周边有柑橘作物的茶园应加强田间监测工作。

关键词:柑橘始叶螨;;叶螨科;;线粒体基因组;;系统发育

基金资助:国家现代农业产业技术体系(CARS-19)