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作者：林冉冉;王宏伟;焦慧君;董肖昌;关秋竹;魏树伟;聂宗省;张玮玮;冉昆;
单位：山东农业大学园艺科学与工程学院;山东省果树研究所;山东如燚农业科技发展有限公司;
摘要：本研究以‘金如意’山楂叶片为材料，利用Illumina高通量测序技术对其叶绿体基因组进行测序，对序列进行组装和分析，并对34种蔷薇科植物的叶绿体基因组进行系统进化分析。结果表明，‘金如意’山楂叶绿体基因组全长159 655 bp, GC含量36.65%,包含一个87 748 bp的大单拷贝(LSC)区、一个19 139 bp的小单拷贝(SSC)区和一对26 384 bp的反向重复(IR)区；共编码130个基因，包括85个蛋白编码基因、37个tRNA基因和8个rRNA基因；共检测到264个SSR位点和57个重复序列，其中SSR位点大部分由A和T重复碱基组成；高频密码子(RSCU>1)有31个，其中以A/U结尾的有29个；与其他蔷薇科植物相比，‘金如意’山楂叶绿体基因组IR区边界相对保守。系统进化分析表明，‘金如意’山楂与大果山楂(Crataegus pinnatifida var. major)亲缘关系最近，属于大果山楂类型。研究结果可为山楂种质资源鉴定、遗传多样性研究和资源开发利用奠定基础。
关键词：‘金如意’山楂;;叶绿体基因组;;系统进化分析
基金资助：山东省重点研发计划(农业良种工程)项目(2024LZGC029);山东省重点研发计划(乡村振兴科技创新提振行动计划)项目(2024TZXD041);; 科技基础资源调查专项专题任务“华东地区山楂野生优特异种质资源调查”(2024FY100502-7);; 泰安市农业良种工程项目(2025NYLZ06)
