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作者：陈增汀;王亚丽;张燕玲;孔颖;田皓韦;吴艳梅;隋娜;
单位：山东师范大学生命科学学院;
摘要：ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,三磷酸腺苷结合盒转运蛋白)是植物中最大的转运蛋白家族之一，可以将代谢物质进行细胞跨膜运输，在植物生长发育以及抵御逆境过程中发挥重要作用。本研究对高粱ABC基因进行全基因组鉴定，最终筛选出135个SbABC基因。根据蛋白结构域将它们分为8个亚家族，按照染色体位置分别进行命名，并对它们的进化关系、基因结构、蛋白质基序、启动子顺式作用元件等进行预测分析，同时对它们在盐胁迫下的表达模式进行分析。结果表明，SbABC基因不均匀地分布在高粱10条染色体上，其中3号染色体上的ABC基因数量最多；通过构建系统进化树发现，高粱和拟南芥ABC基因的聚类关系与结构域分类保持一致；基序分析发现，有的基序在大部分ABC蛋白中存在，有的基序仅在特定亚族中存在，这可能与它们功能上的分化有关；ABC基因启动子含有脱落酸响应、逆境响应以及MYB识别位点等顺式作用元件，推测它们与高粱生长及胁迫响应有关。通过分析转录组数据发现，大部分SbABC基因在高粱根、茎和叶中均有表达。实时定量PCR(qRT-PCR)检测结果显示，在外源ABA(100μmol/L)和NaCl(150 mmol/L)处理下，SbABCF3和SbABCG22基因均被显著诱导表达。本研究结果有助于了解ABC基因家族在高粱生长以及耐盐过程中的作用，为高粱耐盐机制研究以及耐盐作物培育提供了新的思路。
关键词：高粱;;ABC转运蛋白;;生物信息学分析;;盐胁迫;;表达分析
基金资助：国家重点研发计划项目(2022YFD1201702)
