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作者：刘园园;左扬;王祎菲;高广娟;周磊;金艺鹏;原霖;张嵘;苏小艳;史喜菊;薛峰;王少林;
单位：中国农业大学三亚研究院海南省食品安全监测及检测技术创新中心;中国农业大学动物医学院兽医公共卫生安全全国重点实验室;北京中科基因技术股份有限公司;浙江大学医学院附属第二医院检验科微生物室;成都大熊猫繁育研究基地;中国海关科学技术中心;中国药科大学工学院;
摘要：高通量测序（NGS）及相关生物信息学的发展，显著提升了基因组数据的获取和分析能力。目前，NGS已广泛应用于动物传染病研究，在未知病原鉴定、已知病原流行病学分析及病原群落宏基因组研究中展现出重要价值，并为疾病精准诊断、监测和预警提供支撑。本文旨在综述NGS技术在兽医公共卫生领域的应用现状和发展趋势，重点分析其在动物病原检测、疫病诊断及流行病学监测和预警过程中的潜在价值，并探讨该技术在大规模应用中的机遇和前景，不仅有助于提高动物病原微生物的检测效率和准确性，还对保障公共卫生安全、预防和控制动物源性传染病的传播具有重要意义。
关键词：高通量测序(NGS);;病原微生物;;兽医公共卫生;;诊断控制
基金资助：北京市自然科学基金（6222033）;; 病原体精准识别检测与计量溯源关键技术研究及应用（2024YFF0618100）;; 国家现代农业产业技术体系资助（CARS36）
