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作者：黄孟锟;闫昊;张研博;张皓博;张培培;孙翔翔;樊晓旭;
单位：中国动物卫生与流行病学中心;新疆维吾尔自治区动物疫病预防控制中心;农业农村部反刍动物重大疫病防控重点实验室(东部);农业农村部动物生物安全风险预警及防控重点实验室(南方);青岛市动物生物安全重点实验室;
摘要：虫媒病毒经节肢动物传播，对人类健康和畜牧业生产构成威胁。为了解新疆与云南地区独特的地理和气候条件下虫媒病毒的多样性，并对其进行监测。本试验采用高通量测序（HTS）结合生物信息学方法，对新疆维吾尔自治区精河县和温泉县养殖场的蜱虫样本，以及云南省大理白族自治州养殖场的蚊子、苍蝇、白蛉样本开展宏病毒组学分析。结果显示，在204个节肢动物样本中，共鉴定到26个病毒科/目，35条完整或近乎完整病毒Contigs，包含8个脊椎动物相关病毒科，其中有5条Contigs与非冗余蛋白序列（NR）数据库中所有已注释病毒的病毒RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp）编码区氨基酸序列的最高同源性均低于90%。云南省大理白族自治州蚊子样本的病毒多样性和丰度最高，以弹状病毒科（Rhabdoviridae）和中套病毒科（Mesoniviridae）为主，新疆维吾尔自治区的蜱虫样本中则以布尼亚病毒目（Bunyavirales）和楚病毒科（Chuviridae）为主。云南省蚊子样本中检出的南定（Nam dinh）病毒与越南脑炎患者以及深圳市和云南省检出的该病毒同源性极高（大于97%或99%）。系统发育分析结果显示，部分新发现病毒与未分类病毒形成独立分支，可能为潜在新病毒属。结果表明，新疆和云南地区养殖场节肢动物所携带的病毒不仅具有丰富的遗传多样性，还存在潜在新病毒属和跨宿主传播风险。本试验结果可为保障畜牧业生产安全和公共卫生安全提供科学依据。
关键词：蜱虫;;蚊子;;虫媒病毒;;高通量测序(HTS)
基金资助：现代农业(奶牛)产业技术体系建设专项(CARS-36)
