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作者：谷博;王安琪;郭俊彤;于鑫淼;杨一;姜怀志;
单位：吉林师范大学生命科学学院;吉林农业大学动物科学技术学院;
摘要：本文旨在深入探究不同品种绵羊卵巢发育过程中lncRNA(长链非编码RNA)的分子调控机制,挖掘绵羊繁殖相关基因,为提高绵羊生产效率提供参考。本研究构建多胎型(小尾寒羊)和单胎型(乌珠穆沁羊)绵羊卵巢组织非编码RNA表达谱,通过高通量测序分析,筛选差异表达DE lncRNA、DE miRNA及DE mRNA,并对其进行靶基因预测以及功能和信号通路富集分析,进一步构建ceRNA(lncRNA-miRNA-mRNA)调控网络。结果显示,乌珠穆沁羊和小尾寒羊卵巢组织中共筛选出差异表达lncRNA共1 579个、miRNA共175个及mRNA共3 095个。差异表达lncRNA靶基因的富集分析注释到类固醇生物合成、酮体的合成分解、组氨酸代谢等繁殖相关信号通路,结合ceRNA网络筛选出了2个调控绵羊卵巢发育的关键lncRNA。lncRNA MSTRG.26091可能通过结合bta-miR-331-3p,进而调控靶基因SDR42E2的表达;lncRNA MSTRG.18078可能通过结合bta-miR-197,进而调控靶基因BCAS1的表达,二者均通过参与到类固醇生物合成信号通路影响绵羊的卵巢发育。采用qRT-PCR方法对随机选取的9个差异表达基因进行了验证,结果证实了RNA-seq测序的准确性。
关键词：乌珠穆沁羊;;小尾寒羊;;卵巢;;lncRNA;;ceRNA网络
基金资助：吉林省科技发展计划(20210101049JC)
