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中国草食动物科学2025年第06期:甘南牦牛的母系遗传多样性再评估

来源:期刊VIP网 时间:


作者:刘瑞林;盛欣;吴志鹏;李瑞哲;陈生梅;马志杰;

单位:青海大学畜牧兽医科学院;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室;

摘要:为进一步在分子水平上探究甘南牦牛的母系遗传多样性、群体遗传结构和遗传背景,本研究在测定34头甘南牦牛mtDNA D-loop区序列的基础上,从GenBank下载了23条已公布的甘南牦牛mtDNA D-loop区序列,使用BioEdit v7.2.5、DnaSP 5.10.01、Arlequin 3.11等生物信息学软件对共计57条甘南牦牛mtDNA D-loop区序列进行综合分析。结果表明,在57条甘南牦牛mtDNA D-loop区序列中,共计检测到33个简约信息位点、4个单一多态位点,根据序列间核苷酸变异共确定了19种单倍型。通过遗传多样性分析发现,相比于我国野牦牛和其他17个家牦牛品种,甘南牦牛拥有较高的单倍型多样度(0.922±0.017)和核苷酸多样度(0.016±0.008),提示甘南牦牛的母系遗传多样性水平较高。在系统发育分析中发现,19种单倍型分布在2个母系遗传分支(Mt-Ⅰ,Mt-Ⅱ),其中Mt-Ⅰ支系由A、B、E三种单倍型组组成,占比78.95%;Mt-Ⅱ支系包括C和D两种单倍型组,占21.05%,故推测甘南牦牛有2个母系起源。

关键词:甘南牦牛;;线粒体基因组;;遗传多样性;;系统发育

基金资助:青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”计划(领军人才)项目;; 全国畜禽遗传资源普查项目