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作者：裴全帮;左明星;李蓉;徐腾;祁军英;田得红;
单位：青海省种羊繁育推广服务中心;海西州德令哈市怀头他拉镇综合服务中心;中国科学院西北高原生物研究所;
摘要：本研究旨在通过针对不同羊毛纤维特征的皮肤转录组测序分析，筛选出调节毛囊发育的关键候选基因，为深入揭示驱动藏羊羊毛性状发育的分子机制提供重要依据。采集成年高原型藏羊和欧拉羊的皮肤组织，进行石蜡切片和苏木精-伊红染色（HE）；采用Illumina NovaSeq平台进行高通量测序（PE150）；利用DESeq2进行差异表达基因（DEGs）分析（~|log_2FC~|>1,FDR<0.05），结合GO、KEGG数据库进行功能富集分析；并通过qRTPCR对候选基因进行表达验证。毛囊形态学研究表明，初级毛囊具有较大的直径和完整的结构，而次级毛囊则表现出较小的直径且数量较多。此外，高原型藏羊的毛囊密度较低，毛囊间间距较大；相比之下，欧拉羊的毛囊密度较高，毛囊间间距较小。转录组测序结果显示，共鉴定出1 065个DEGs，其中上调基因434个，下调基因631个。通过GO和KEGG功能富集分析发现，这些DEGs显著富集于Wnt信号通路、细胞外基质受体相互作用、PPAR信号通路、黏附、PI3K-Akt信号通路，其中THBS3、COL6A3、COL6A2、COL6A1、COL1A1、COL1A2、OVOL2、MYOC、FABP3、MMP1、KIT、FGF5、DKK1、MMP7、WNT7B和WNT16等关键基因在毛囊发育的调控中发挥重要作用。qRT-PCR结果显示，所选的7个DEGs的皮尔逊相关系数为0.77,P值为3.95×10~(-5)，表明RNAseq数据具有较高的可靠性。本研究筛选到的THBS3、COL6A3、COL6A2、COL6A1、COL1A1、COL1A2、OVOL2、MYOC、FABP3、MMP1、KIT、FGF5、DKK1、MMP7、WNT7B和WNT16等关键基因表现出显著的差异表达模式，为揭示藏羊毛囊发育的分子机制提供了重要理论基础。
关键词：高原型藏羊;;皮肤组织;;形态学;;转录组
基金资助：青海省自然科学基金项目（2023-ZJ-748）
