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作者:邓婧瑛;陈倩;王佟;于沁冉;张明昊;马超凡;李宁;包鹏甲;阎萍;贾建磊;
单位:青海大学农牧学院;齐鲁师范学院;中国农业科学院西部农业研究中心;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;
摘要:本研究旨在探究牦牛FGF10基因的结构和功能,并分析其在帕米尔牦牛8个组织中的表达规律。以帕米尔牦牛肌肉组织cDNA为模板,采用PCR技术克隆FGF10基因的CDS区,通过生物信息学方法对该基因序列进行分析,结合qRT-PCR对帕米尔牦牛8个不同组织样本的FGF10基因表达水平进行定量检测。结果表明,帕米尔牦牛FGF10基因的编码序列(CDS区)长度为642 bp,共编码213个氨基酸。同源性比对结果表明,帕米尔牦牛与野牦牛和家牛的相似性最高,为100%;与小家鼠的相似性最低,为90.1%。生物信息学分析结果显示,帕米尔牦牛FGF10蛋白的分子式为C_(1 049)H_(1 639)N_(299)O_(307)S_(13),原子总数、不稳定指数和总平均亲水指数分别为3 307、45.07和-0.358,表明该蛋白为稳定性亲水蛋白。信号肽分析证明FGF10蛋白属于分泌型蛋白,且含跨膜螺旋结构,经亚细胞定位分析发现,该蛋白主要分布在胞外环境中。其分子结构中包含2个N糖基化位点,同时存在47个潜在磷酸化位点。此外,FGF10蛋白的二级结构以无规则卷曲为主要构成形式,与FGFR1、FGFR2和FLT1等蛋白存在互作关系。FGF10基因在8个组织中的表达规律分析结果表明,不同组织间的表达存在差异,其中,背最长肌组织中的相对表达量最高,显著高于其余7个组织(P<0.01)。
关键词:帕米尔牦牛;;FGF10基因;;基因克隆;;组织表达
基金资助:青海省昆仑英才高端创新创业人才培养拔尖人才项目(QHKLYC-GDCXCY-2023-154);; 青海大学实验(实践)课程建设项目(SYKC-2023-03);; 深圳市科技计划项目(KCXF20201221173205015);; 新疆天池英才项目(CTYC-TP2023)