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作者：杨瑞军;黄世腾;吕磊;王双青;游佳玲;王晓光;
单位：浙江省衢州市疾病预防控制中心;浙江省丽水市疾病预防控制中心;
摘要：目的 对衢州市1例猴痘患者开展流行病学处置及病原分子溯源，为衢州地区猴痘防控工作提供技术性支持。方法 针对猴痘患者进行现场流行病学特征调查，并采集患者咽拭子、疱疹液、血清进行猴痘病毒核酸检测，确认阳性后进行全基因组测序，利用生物信息学软件进行多序列比对排列及构建进化树。结果 经检测，该患者的咽拭子、疱疹液、血清标本猴痘病毒核酸检测结果均为阳性，基因序列比对及进化分析，病毒株型别属于IIb C.1.1，与广东病毒株（登录号EPI ISL 19909018、EPI ISL 19909011）亲缘关系最近，与参考基因组（NC＿063383.1）相比，核苷酸同源性为99.89%，核苷酸平均遗传距离为0.001。基因编码区内发生16个氨基酸位点替换，其中OPG153编码区共发生1个氨基酸变异，2个氨基酸位点缺失；未发生氨基酸位点插入。结论 衢州市猴痘患者感染的病毒与我国其他地区流行株的基因型一致，后续应持续关注病毒遗传进化情况，警惕新变异株出现。
关键词：猴痘;;猴痘病毒;;全基因组测序;;序列分析;;生物信息学
