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中国防痨杂志2024年第05期:基于非靶向脂质组学分析脂蛋白Rv1411c对结核分枝杆菌脂质代谢的影响

来源:期刊VIP网 时间:


作者:孙玉亭;全舒婷;孙柏旭;田雪;綦辉;焦伟伟;申阿东;孙琳;

单位:国家儿童医学中心/首都医科大学附属北京儿童医院/北京市儿科研究所/儿科学国家重点学科/儿科重大疾病研究教育部重点实验室/国家呼吸系统疾病临床医学研究中心/儿童呼吸道感染性疾病研究北京市重点实验室;

摘要:目的:基于非靶向脂质组学探索结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)脂蛋白Rv1411c在该菌脂质代谢中的作用。方法:构建敲除编码脂蛋白Rv1411c基因的MTB(ΔRv1411c)菌株,测定ΔRv1411c与MTB标准株H37Rv的吸光度值(A_(600)值)并绘制两者生长曲线。提取ΔRv1411c与H37Rv菌液上清脂质成分,使用液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术及非靶向脂质组学分析平台对菌株的差异脂质进行分析。采用偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析等方法分析两者的差异脂质代谢产物及差异脂质分子的富集通路。结果:通过色谱分离及质谱分析,从ΔRv1411c与H37Rv菌株中成功鉴定出归属于28种脂质亚类的460个不同的脂质分子,再通过PLS-DA模型分析获得其中归属于17种脂质亚类的158个差异脂质分子[变量权重值(VIP)>1]。以变异倍数(FC)>1.5或<0.67且P<0.05为筛选标准,共筛选出36个具有显著差异的脂质分子,其中有12个脂质分子上调,24个脂质分子下调。经KEGG通路富集分析,差异脂质代谢产物主要富集于以下8种通路,即:甘油磷脂代谢、亚麻酸代谢、α-亚麻酸代谢、糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成、甘油脂代谢、鞘脂代谢、花生四烯酸代谢及不饱和脂肪酸的生物合成通路;其中又以甘油磷脂的代谢通路最为重要,其次为甘油脂代谢及糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚的生物合成通路。结论:脂蛋白Rv1411c可显著影响MTB的脂质代谢,可能参与MTB脂质代谢的调控。

关键词:分枝杆菌,结核;;脂蛋白类;;脂类代谢;;脂质组

基金资助:国家自然科学基金(82170007);; 北京市自然科学基金(7222055);; 保定市科技计划项目(2272P010)~~