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作者：王宇;殷乙凯;王语诗;吴茜;张健;段梦琪;强巴央宗;商鹏;
单位：西藏农牧学院动物科学学院;藏猪遗传改良与繁殖工程重点实验室;西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心;
摘要：为了探究ALDH4A1基因在藏猪和大约克猪中的多态性和表达差异分析，试验以30日龄、90日龄及180日龄的藏猪和大约克猪为试验动物，分别提取DNA和RNA,采用实时荧光定量PCR技术对其背部脂肪组织中ALDH4A1基因mRNA的相对表达量进行检测，并使用一代测序Sanger法，分别对藏猪和大约克猪的ALDH4A1基因起始密码子上游约3 kb区域进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点进行筛选并挑选出具有有效突变意义的SNP位点，继续扩大样本进行单个个体测序，对测序结果进行基因型频率与等位基因频率统计。结果表明：在背部脂肪组织中，藏猪和大约克猪ALDH4A1基因mRNA的相对表达量均随着日龄的增长呈逐渐升高的趋势，且30日龄、90日龄、180日龄藏猪ALDH4A1基因mRNA的相对表达量均极显著高于大约克猪(P<0.01)。在ALDH4A1基因起始密码子上游3 kb区域存在T-1541G、G-1533A、T-1292C、T-1082C、G-1027C 5个突变位点，其中T-1541G在藏猪和大约克猪中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),G-1533A、T-1292C、T-1082C、G-1027C在藏猪群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在大约克猪群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。说明ALDH4A1基因在猪的脂肪沉积性状方面具有调控作用。
关键词：藏猪;;大约克猪;;ALDH4A1;;多态性;;mRNA表达
基金资助：国家重点研发计划项目(2022YFD1600900);; 西藏自治区重大科技专项(XZ202101ZD0005N);; 西藏自治区基地与人才计划科技项目(XZ202202JD0002N)
