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作者：王蔚;李马超;薄相龙;刘海灿;杭昊;赵秀芹;万康林;赵丽丽;
单位：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室;
摘要：目的 分析乙硫异烟胺（ETH）作用下耻垢分枝杆菌mc~2155转录组的差异表达基因，探究与ETH作用机制相关的基因。方法 微孔板肉汤稀释法测定mc~2155的最小抑菌浓度（MIC）。以1/4 MIC ETH处理的mc~2155菌株作为药物处理组，无ETH处理的菌株作为对照组，提取细菌总RNA进行转录组测序分析，筛选差异表达基因（DEGs），并进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。随机选取9个DEGs，反转录定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）对转录组测序结果进行验证。结果 转录组分析结果显示，与对照组相比，ETH处理组共有527个DEGs，其中有174个基因表达上调，353个基因表达下调。GO富集分析结果显示，DEGs主要涉及腺嘌呤核苷三磷酸酶活性、水解酶活性、跨膜转运蛋白活性等分子功能，以及跨膜运输、定位等生物过程。KEGG富集分析结果显示，DEGs主要集中在次生代谢物的生物合成、腺苷三磷酸结合盒转运蛋白、不同环境下的微生物代谢、双组分系统等通路。DEGs的RT-qPCR结果与转录组测序结果差异表达变化趋势一致。结论 乙硫异烟胺能显著影响耻垢分枝杆菌基因的表达，涉及多个功能基因和代谢通路，具体的调控机制有待进一步研究。
关键词：乙硫异烟胺;;耻垢分枝杆菌;;转录组测序;;差异表达基因;;耐药性;;结核病
基金资助：传染病重大专项课题(No.2018ZX10302302)~~
