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作者：于可艺;李艳君;黄振洲;付秀萍;白雪梅;王多春;阚飙;高鹤;
单位：浙江省疾病预防控制中心;解放军总医院第六医学中心;杭州市疾病预防控制中心(杭州市卫生监督所);中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;
摘要：目的 建立溶藻弧菌的多位点序列分型（MLST）方法，以对溶藻弧菌进行克隆群分类、地域和来源分布研究与追溯。方法 收集国内外溶藻弧菌分离株并筛选出8个管家基因（atpA、dnaE、ftsZ、gyrB、mdh、purM、pyrH、tnaA），设计特异性引物。通过聚合酶链式反应（PCR）扩增测序、数据库来源基因组BLASTn比对获取分离株管家基因序列。进一步评估管家基因分辨率，并根据8个管家基因序列差异定义等位基因谱和序列型（STs），随后进行STs聚类分析、最小生成树构建及管家基因串联序列最大似然法进化树构建。结果 管家基因多态性评价提示，所选管家基因具有丰富的突变位点和分辨率，在演化历程中遗传进化速率不同，可以满足MLST分析的要求。等位基因谱共定义了184种STs，分别编号ST001～ST184；共鉴定到24个克隆群（CCs），分别编号为CC1～CC24。大多数菌株呈现出零散分布的态势，菌株之间的系统发育关系在分离地区、分离年代和宿主来源上尚未发现明确关联。结论 本研究所建立的溶藻弧菌MLST方法可对其进行克隆群分类、地域和来源分布研究与追溯。
关键词：溶藻弧菌;;多位点序列分型;;方法建立;;管家基因
基金资助：国家重点研发计划(No.2022YFC2302800);; 浙江省自然科学基金(No.LY20H190001);; 浙江省医药卫生科技计划项目(No.2023KY641)~~
