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作者：孙慧颖;樊粉霞;杜小莉;阚飙;崔志刚;闫梅英;
单位：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室;
摘要：目的 回顾性分析2020—2023年我国鼠伤寒沙门菌的耐药表型及遗传特征，揭示菌株间遗传进化关系及可能的流行规律。方法 对2020—2023年分离的1874株鼠伤寒沙门菌进行17种抗生素的药物敏感性试验。对全部菌株进行基因组测序，利用ResFinder数据库进行耐药基因鉴定，并构建基于核心基因组单核苷酸多态性（SNPs）的系统发育树进行遗传进化分析。结果 1874株鼠伤寒沙门菌对17种抗生素呈现不同程度的耐药，总耐药率为96.80%，对氨苄西林耐药率最高（82.44%），对头孢噻肟及头孢他啶的耐药率为22.20%和11.66%，对氯霉素、链霉素和氨苄西林的耐药率呈现逐年上升趋势。多重耐药率高达87.14%，主要耐药谱为四环素–链霉素–氨苄西林三重耐药。共检测到耐药基因113种，覆盖氨基糖苷类、大环内酯类和四环素类等共11类抗菌药物，其中β-内酰胺类占比最高（77.37%），且大多数耐药基因携带率逐年增加。多数种类抗生素耐药基因和耐药表型一致性较好。多位点序列分型以序列型（ST）34型为主（61.79%）。基于核心基因组SNPs的系统进化树表明我国鼠伤寒沙门菌主要分为3个流行谱系，不同谱系的序列ST型别及携带耐药基因情况不同。发现3起聚集，其中2起经流行病学确认为暴发，1起为未被识别的潜在暴发。另外，发现14株（0.75%）耐美罗培南菌株。结论 我国鼠伤寒沙门菌存在遗传多样性，携带多种耐药基因并表现多重耐药的ST34型为优势流行型别。耐药基因数量的逐年增加及新出现较多的碳青霉烯类耐药，提示应加强耐药监测和耐药相关风险因素调查研究，防止高耐、泛耐药克隆形成及扩散。
关键词：鼠伤寒沙门菌;;耐药;;全基因组测序;;群体遗传学
基金资助：深圳市医学研究专项资金(No.B2403009);; 公共卫生应急反应机制的运行(No.102393220020020000029)~~
