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作者：尹明华;张牧彤;徐子林;欧阳茜;王美暄;李文婷;
单位：上饶师范学院生命科学学院;上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室;
摘要：茶树‘大面白’（Camellia sinensis cv.‘Damianbai’）是上饶市广信区自主培育的国家级品种，其线粒体基因组结构特征及密码子偏好性尚不清楚。以‘大面白’为试验材料，采用高通量测序技术对其线粒体全基因组进行测序、组装、注释，采用生物信息学软件对其线粒体基因组的结构特征和密码子偏好性进行分析。结果表明，‘大面白’线粒体基因组全长886 354 bp，结构为完整单环状分子，GC含量为45.76%；共注释到78个功能基因，包括41个蛋白质编码基因，33个tRNA基因，4个rRNA基因；共检测到59个SSR（主要为A/T单核苷酸重复）和100个Longrepeat（主要为正向重复和回文重复）。‘大面白’线粒体基因组密码子偏好性较弱，密码子偏好以A/U结尾，密码子使用偏好性主要受自然选择的影响，受内部突变压力的影响小；‘大面白’线粒体基因组的最优密码子为14个（AAU、GAU、CAU、UUU、AUU、GCU、GGA、ACU、GUU、CGA、UUA、UUG、UCA、UCU）。11个近缘物种的线粒体基因组在基因区与‘大面白’线粒体基因组具有高度同源性；‘大面白’线粒体基因组与‘凌云白毫’（ON782577）线粒体基因组的共线性最高，两者的基因排列顺序基本一致；‘大面白’线粒体基因组与其叶绿体基因组之间具有62个高度同源性的基因片段；‘大面白’与‘凌云白毫’单独聚成一小分支，两者亲缘关系较近。本研究分析了‘大面白’线粒体基因组序列特征及系统发育进化关系，为加强‘大面白’种质鉴定及其资源多样性的开发利用提供了参考依据。
关键词：‘大面白’;;线粒体基因组;;结构特征;;密码子偏好性
基金资助：国家自然科学基金项目（31960079、31860084、32060092）;; 2024年省级大学生创新创业训练计划项目（2024-PX-25）
