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作者：康龙山;于慧茹;杨德全;李鑫;沈海潇;杨显超;王建;徐丽娜;葛菲菲;
单位：河北工程大学生命科学与食品工程学院;上海市动物疫病预防控制中心;
摘要：猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染引起的仔猪严重腹泻性疾病，传播快，发病急，死亡率高，给我国养猪业造成巨大损失。2021年10月上海某猪场产房仔猪发生腹泻，发病率为30%～50%，死亡率为20%～30%，猪群之前进行过疫苗免疫。粪便样本经猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪轮状病毒（RV）荧光RT-PCR检测，结果显示：PEDV检测为阳性，TGEV和RV检测均为阴性。经全基因测序后进行系统进化分析，结果显示：全基因序列属于GⅡ-c亚群，S基因序列属于GⅡ-b亚群，与目前的经典疫苗株CV777和变异株AJ1102相比，CV777的全基因和S基因都属于GⅠ-b群，AJ1102的全基因和S基因都属于GⅡ-b亚群，研究结果表明新基因型的PEDV已在上海地区流行，而传统疫苗株无法提供好的免疫效果，提示新的防控策略的制定和有针对性的疫苗的生产和使用，对于预防PEDV感染和流行有重要意义。
关键词：猪流行性腹泻病毒;;系统进化;;S基因
基金资助：上海市科委自然科学基金（2021(04713)）
