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作者:李希;宋菲菲;王曦;王宏浩;吴苏君;张元庆;张变英;
单位:山西农业大学动物科学学院;山西农业大学生态农牧研究所;
摘要:为研究晋南牛载脂蛋白A1(ApoA1)基因的结构、生物学功能及其在不同组织中的表达变化规律,本试验以晋南牛肝脏组织总RNA为模板,克隆ApoA1基因序列,并利用多种生物信息学在线分析软件对晋南牛的ApoA1基因进行生物信息学分析及构建系统发育进化树。利用荧光定量PCR方法检测晋南牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏等组织中ApoA1基因的表达情况。结果表明,晋南牛ApoA1基因的CDS序列全长852 bp,与黄牛ApoA1基因的同源性为98.00%。晋南牛ApoA1蛋白的分子量为30 276.35 Da,由265个氨基酸残基构成,属于亲水性蛋白,有20处磷酸化位点。在ApoA1的二级结构中,α-螺旋占92.08%,属于全α类蛋白。ApoA1蛋白与ApoA2、ApoB、ApoE、ApoC2、ApoC3、SCARB1、LPL、ABCA1等蛋白存在相互作用。基于ApoA1序列同源性构建的系统发育进化树表明,晋南牛与黄牛的亲缘关系最近,与野牛的亲缘关系最远。ApoA1基因在晋南牛肝脏、心脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中均有表达,且以肝脏中的相对表达量最高,肾脏中的相对表达量最低。
关键词:晋南牛;;ApoA1;;克隆;;组织表达
基金资助:山西省青年科学基金项目(202103021223162);山西省青年科学基金项目(20210302124640);; 山西省科技重大专项计划(202201140601026-1);; 山西现代农业产业技术体系建设项目(2024CYJSTX13-04)