我们的服务符合学术规范和道德
专业 高端让您使用时没有后顾之忧

中国草食动物科学2025年第01期:牛miR-155靶基因预测及其组织表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:何学亮;徐俊杰;姬小云;丁燕玲;曲畅;周小南;梁嘉豪;魏大为;史远刚;康晓龙;

单位:宁夏大学动物科技学院;宁夏伊康元生物科技有限公司;

摘要:为探究bta-miR-155在牛重要组织中的潜在功能,使用miRDB、TargetScan和miRWalk在线软件预测bta-miR-155靶基因,利用DAVID在线数据库对预测靶基因进行GO注释和KEGG通路富集分析;利用MEGA11.0软件对牛、人、猪、狗、大鼠、家鼠、山羊和恒河猴的miR-155进行保守性分析并进行系统进化树构建;最后利用RT-qPCR技术对bta-miR-155在牛主要组织心、脾、肺、肾、睾丸、股二头肌和背最长肌中的表达进行检测。结果表明,bta-miR-155位于牛基因组1号染色体,其成熟序列在各物种间保守性较高,只有猪、家鼠和大鼠在12 nt或23 nt处不完全保守或缺失,且有24个预测靶基因;GO功能分析发现,bta-miR-155靶基因富集程度高的条目主要有RNA聚合酶Ⅱ启动子对pri-miRNA转录的正向调控、NF-kappaB转录因子活性的正调控、白细胞介素-1 β产生的正调控、平滑肌细胞增殖的正向调节和成肌细胞分化的负调控等;KEGG通路显著富集于脂质和动脉粥样硬化、白细胞分化抗原36、固醇调节元件结合蛋白1、NOD样受体、白细胞介素18和脂肪细胞因子等信号通路。bta-miR-155的组织表达分析结果表明,bta-miR-155在成年牛股二头肌中的表达量最高,在心肌中的表达量最低;成年牛背最长肌中bta-miR-155的表达量显著高于犊牛(P<0.05)。综上,btamiR-155在牛肌肉组织中的高表达提示其可能在肌肉生长发育过程中发挥重要作用,为后续开展bta-miR-155在牛肌肉发育、肌纤维类型转化中的分子功能探究奠定了基础。

关键词:牛;;bta-miR-155;;靶基因预测;;组织表达

基金资助:国家自然科学基金项目(32160776);; 现代农业产业技术体系(CARS-36);; 中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(XAB2022YW11);; 宁夏高等教育质量提升工程项目