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中国草食动物科学2024年第06期:梅花鹿鹿茸顶端茸皮组织PIM1基因生物信息学及表达分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:李梦茹;宋雪晴;李想;路鑫浩;夏彦玲;

单位:东北林业大学野生动物与自然保护地学院;

摘要:为了研究梅花鹿(Cervus nippon)PIM1基因的结构和功能,利用RT-PCR技术扩增梅花鹿PIM1基因,获得该基因的cDNA序列,对PIM1基因及其蛋白的基本性质进行生物信息学分析,并根据PIM1蛋白的同源序列对比结果构建系统进化树,同时对PIM1基因在鹿茸生长前、中、后期顶端茸皮组织中的相对表达量进行检测。结果表明,梅花鹿PIM1基因的CDS序列全长942 bp,共编码313个氨基酸;PIM1蛋白是一种亲水性较强且无信号肽的不稳定蛋白,主要定位在细胞质和细胞核;同源性分析可知,梅花鹿PIM1蛋白与白尾鹿、黇鹿、马鹿的PIM1蛋白氨基酸序列相似度高达98.50%以上;PIM1蛋白的二级结构由43.45%的无规则卷曲、36.10%的α-螺旋、12.78%的延伸链以及7.67%的β-转角组成;实时荧光定量RT-PCR结果表明,PIM1基因在鹿茸生长后期的表达量极显著高于生长前期(P<0.01)和生长中期(P<0.01)。说明PIM1基因可能在梅花鹿鹿茸生长后期起着促进骨化的作用。

关键词:梅花鹿;;PIM1基因;;基因克隆;;生物信息学分析;;实时荧光定量RT-PCR

基金资助:大学生创新训练项目(202310225525)