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作者：帕里旦古丽·阿不都热合曼;王森路;古丽娜·巴德尔汗;王乐;祖力卡提阿衣·阿布都拉;王新旗;买吾拉江·依马木;王希江;
单位：新疆医科大学公共卫生学院;新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心;新疆喀什地区疾控预防控制中心;
摘要：目的:了解喀什地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)基因型分布情况，以及基因分型与肺结核患者临床特征之间的关联。方法:收集2020年喀什地区结核病定点医院临床分离的MTB菌株，将其中有完整病例信息的810例肺结核患者和其对应的810株MTB临床分离株纳入研究。肺结核患者的个案信息从“结核病管理信息系统”中调取，包括患者的姓名、性别、年龄、职业等基本信息和临床症状、影像学表现、治疗史、治疗方案、治疗结局等。采用Illuminate HiSeq二代测序平台对MTB菌株进行基因分型，并鉴定谱系。结果:810株MTB中Lineage2谱系292株(36.0%)、Lineage3谱系321株(39.6%)、Lineage4谱系197株(24.4%)。喀什市、疏附县、疏勒县等县、市的MTB的谱系分布不均；有效测得的572株亚谱系中Lineage2.2.1亚谱系占44.6%(255/572)、Lineage2.2.2亚谱系占6.8%(39/572); Lineage3.1.3亚谱系占14.9%(85/572);Lineage4谱系分化较广，即Lineage4.1～4.9,其中Lineage4.5亚谱系占29.9%(171/572)。菌株谱系与患者临床症状之间差异不明显；相较其他谱系，Lineage3谱系菌株感染者痰涂片阳性比例更低(27.7%,89/321),但明确治愈者的比例更高(37.1%,119/321),差异均有统计学意义(χ~2值分别为6.192和24.558,P值均<0.05)。结论:喀什地区MTB谱系、亚谱系分布呈基因多态性，Lineage3谱系感染患者涂片阳性率较低，临床治愈率较高。
关键词：分枝杆菌,结核;;基因组,细菌;;多态性,单核苷酸;;疾病特征
基金资助：新疆维吾尔自治区重点研发专项(2021B03003-1);; 喀什地区科技局课题(KS2020018)~~
