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山西大学学报(自然科学版)2025年第02期:基于生物信息学与实验验证的柴胡-白芍抗乳腺癌机制研究

来源:期刊VIP网 时间:


作者:鲍宁;李肖;

单位:山东中医药大学药学院;山东中医药大学中医药创新研究院;

摘要:通过生物信息学、网络药理学以及实验验证相结合的方法,预测并验证柴胡-白芍药对抗乳腺癌配伍机制。获取癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中乳腺癌基因表达数据,筛选得到乳腺癌靶点;通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database,TCMSP)数据库、SEA(Similarity Ensemble Approach)数据库、Swiss Target Prediction数据库和Super PRED数据库收集柴胡、白芍潜在活性成分及靶点,对靶点进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用网络与成分-靶点网络,筛选得到乳腺癌关键靶点丝氨酸苏氨酸蛋白激酶(Polo-like kinase 1, PLK1)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(cyclin dependent kinase 1, CDK1)及柴胡-白芍抗乳腺癌关键成分柴胡皂苷A、柴胡皂苷B2、柴胡皂苷D和芍药苷;通过Autodock软件对关键成分及靶点进行分子对接验证,并通过细胞实验验证关键成分的抗乳腺癌活性,其中通过Chou-Talalay模型证明了柴胡皂苷D与芍药苷之间存在协同增效作用;通过流式细胞术及蛋白质印迹(Westernblot)实验证明了柴胡皂苷D和芍药苷能够通过阻滞细胞周期于G2/M期发挥抗乳腺癌作用。

关键词:生物信息学;;网络药理学;;柴胡;;白芍;;乳腺癌

基金资助:国家自然科学基金(82204656);; 中国博士后科学基金特别资助(2024T173534)