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中国草食动物科学2024年第01期:SNP芯片评估欧拉藏羊群体遗传多样性和遗传结构

来源:期刊VIP网 时间:


作者:王志武;孙锐锋;赵鹏;郭宏宇;王婷;

单位:山西农业大学动物科学学院;

摘要:为了解欧拉藏羊群体的遗传多样性和遗传结构,利用SNP 50K芯片检测了45只欧拉藏羊(20只公羊、25只母羊)的SNP,并进行了血样DNA提取和检测、基因组DNA的SNA分型和数据质检、群体的PCA分析、近交系数分析、亲缘关系分析、遗传距离分析、家系构建分析。结果表明,45只欧拉藏羊共得到64 734个SNP标记,质检后符合要求的数量为57 066个,其中1号染色体上有6 170个SNP位点,24号染色体上有830个位点;45只欧拉藏羊共检测到380个ROH,ROH平均近交系数为0.034,其中公羊的平均近交系数为0.052,母羊的平均近交系数为0.018,说明欧拉藏羊的近交程度不太高。从家系构建分析可知,欧拉藏羊公羊群体可分为8个家系,有5个家系公羊只有1只。后期应加强后代的扩繁和选育,以保证血统的完整。

关键词:欧拉藏羊;;SNP 50K芯片;;近交系数;;家系构建

基金资助:山西省重点研发项目(2022ZDY114,2022ZDYF114-1,2022ZDYF-2,201903D221004);; 山西省育种联合攻关项目(YZGG-09);; 山西农业大学生物育种工程项目(YZGC130);; 山西省专利专化专项项目(202301004);; 吕梁重点研发项目(2021NYGG-2-14)