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中国草食动物科学2024年第04期:湖羊miR-222前体序列克隆、组织表达及生物信息学分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:赵路;王赛桥;张丙雷;贾万航;孙赛祎;杨佳欣;王玉琴;

单位:河南科技大学动物科技学院;

摘要:为探究miR-222在湖羊生长发育和繁殖功能中的作用,试验通过聚合酶链式反应克隆了湖羊miR-222的前体序列;通过实时荧光定量技术检测了miR-222在湖羊下丘脑、垂体和卵巢中的表达规律;使用DNAStar对miR-222成熟序列进行了保守性分析;使用MEGA 11建立了基因进化树,并分析了miRNA-222在各物种间的亲缘关系;通过miRPathD8、TargetScan和StarBase软件预测了湖羊miR-222潜在的靶基因,并对靶基因进行了GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果表明,试验获得了湖羊miR-222的前体序列;湖羊miR-222在卵巢中的相对表达量显著高于在下丘脑和垂体中的相对表达量(P<0.05);湖羊miR-222的成熟序列与猕猴的亲缘关系最近,在不同物种间具有高度的保守性;湖羊miR-222靶基因预测结果显示,miR-222的潜在靶基因中与繁殖相关的基因有PIK3R1、IGF1、GNAI2和THBS1等;富集到的信号通路包括PI3K-AKT、WnT等,且都在动物繁殖调控中有重要作用。因此,miR-222在湖羊的卵巢发育中可能具有重要的调控作用。

关键词:湖羊;;miRNA;;前体序列;;生物信息学分析;;靶基因

基金资助:国家现代农业产业技术体系(CARS-38)