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作者:马荣;洛桑顿珠;平措占堆;卓玛次仁;尼玛加措;成述儒;梁春年;
单位:中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室;甘肃农业大学;农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所;日喀则市昂仁县农业农村局;
摘要:克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7,MYL7)基因CDS区,进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异,为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR技术克隆其CDS区序列,并利用多种在线生物软件及工具进行生物信息学分析。结果表明,桑桑牦牛MYL7基因CDS区长447 bp,共编码148个氨基酸,该基因编码的蛋白分子式为C_(743)H_(1155)N_(187)O_(237)S_7,原子数为2 329个,理论等电点为4.37,不稳定系数和总平均亲水性分别为36.02和-0.364,属于稳定的亲水性蛋白;具有特异性的磷酸化位点11个,其中5个丝氨酸、5个苏氨酸和1个酪氨酸。MYL7蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白。通过亚细胞定位发现,桑桑牦牛MYL7基因在线粒体、细胞核、细胞质、细胞膜中均有所分布。蛋白高级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲。通过构建系统进化树发现,桑桑牦牛与野牦牛亲缘关系最近,符合实际情况,说明MYL7基因在进化过程中具有一定的保守性。
关键词:桑桑牦牛;;MYL7基因;;基因克隆;;生物信息学分析
基金资助:国家重点研发计划项目(2022YFD1302101);; 西藏自治区区域科技协同创新项目(QYXTZX-RKZ2022-03);; 现代肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)