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东北农业大学学报2025年第01期:玉米穗部叶片叶型结构性状全基因组关联分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:于从超;许家伟;张嘉月;李琛;辜源;李昊;刘显君;李春翔;张林;

单位:东北农业大学农学院;

摘要:玉米穗部叶片(穗上叶、穗位叶、穗下叶)叶型结构是影响株型的重要性状,对产量起决定性作用。以294份叶型结构不同的玉米自交系组成的自然群体为试验材料,通过调查计算穗部叶片叶夹角和叶向值等表型性状,结合5 850 982个SNPs标记进行全基因组关联分析(GWAS)。结果表明:供试材料穗部叶片叶型结构性状差异显著,表现出典型的数量性状特点。检测出极显著相关SNP位点570个(P<1.00×10~(-5)),基于与3个及以上性状显著相关的11个SNP位点预测到11个候选基因,通过功能注释和GO富集分析,筛选出3个可能与玉米穗部叶片叶型结构相关的候选基因(Zm00001d026067、Zm00001d026069和Zm00001d051125),主要参与植物信号转导、氧化还原酶活性和超氧化物代谢通路;推测通过激素信号转导和超氧化物代谢途径,影响细胞分裂速度与增殖方式,进而影响玉米穗部叶片叶夹角和叶向值。qRT-PCR结果表明,3个候选基因在叶型结构差异极显著的4个玉米自交系中均差异表达。

关键词:玉米;;穗部叶片;;叶型;;全基因组关联分析;;候选基因

基金资助:黑龙江省重点研发计划项目(GA21D005)