我们的服务符合学术规范和道德
专业 高端让您使用时没有后顾之忧

作物杂志2025年第06期:豌豆SSR分子标记筛选与指纹图谱的构建

来源:期刊VIP网 时间:


作者:陈浩楠;赵宏岩;张文静;张琦;杜吉到;王琦瑞;任若然;韩毅强;

单位:黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院;黑龙江八一农垦大学农学院;国家杂粮工程技术研究中心;

摘要:利用SSRMMD软件扫描豌豆v1a基因组获得豌豆基因组SSR位点和引物,运用TBtools中的primer check(e-PCR)对发布的豌豆v1a、中豌六号、豌豆07v1和豌豆87v1等4个不同品种豌豆基因组进行电子PCRSSR分子标记多态性分析,利用真实PCR和PAGE电泳验证并构建豌豆指纹图谱。结果显示,豌豆全基因组共扫描出311 601个SSR位点,获得165 288对SSR标记,在7条染色体上均衡分布,选取122对SSR标记,对4个豌豆参考基因组进行电子PCR分析,发现扩增片段均小于300 bp的有差异标记共46对,其中共显性标记29对,显性标记17对;扩增片段无差异的标记有12对,无扩增片段的标记有11对,扩增片段大于300 bp的引物有53对。真实PCR结果显示20对有差异标记中7对具有多态性,其他30对无差异标记中仅2对具有多态性,利用这9对SSR引物成功构建了32个豌豆品种的SSR指纹图谱。本研究表明应用全基因组扫描联合电子PCR方法可以快速获取多态性高、可应用的SSR标记,可用于豌豆种质资源标记和鉴定。

关键词:豌豆;;SSR;;种质资源;;电子PCR;;指纹图谱

基金资助:黑龙江省研究生创新科研项目(YJSCX2022-Y58);; 国家十四五重点研发计划课题(2023YFD1202701)