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作者:张业猛;卢柯欣;毛文钰;张晓燕;李文静;杨修;
单位:济宁学院生命科学与工程学院;中国科学院西北高原生物研究所;
摘要:为分析藜麦LEA基因家族的理化性质、染色体分布、基因结构、蛋白保守基序、物种间共线性及表达模式,利用生物信息学方法对藜麦LEAs进行全基因组鉴定。结果显示,在藜麦基因组中共鉴定到64个LEA基因家族成员,分属7个亚组,分布于13条染色体上,同一亚组的成员具有相似的基因结构和保守基序。种内共线性分析发现,64个LEA基因存在20个重复基因对;种间共线性分析发现,其与豆科植物之间具有高度的进化保守性。LEA基因的启动子区域存在多种激素和非生物胁迫相关的作用元件,其中46个LEA基因受盐胁迫诱导表达,通过GO注释发现主要参与解剖结构发育、根系发育、防御响应和生殖系统发育等生物学过程,各亚组基因发挥不同作用以提升藜麦盐胁迫耐受性。
关键词:藜麦;;LEA基因家族;;盐胁迫;;重复基因;;顺式作用元件
基金资助:山东省自然科学基金青年项目(ZR2024QC385,ZR2024QH647);; 济宁学院“百名卓越人才”(2023ZYRC51,2023ZYRC44)