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安徽医科大学学报2025年第08期:三种不同代谢紊乱相关脂肪性肝炎小鼠模型的转录组比较分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:刘天雯;郭子宜;毕寒琦;周冰;陆炎;毛斐;王华;

单位:安徽医科大学第一附属医院肿瘤科;安徽医科大学炎症免疫性疾病安徽省实验室;复旦大学附属闵行医院内分泌与代谢科;上海交通大学医学院附属上海市第六人民医院,代谢与再生医学研究院,消化内镜中心;复旦大学附属中山医院内分泌与代谢科;

摘要:目的 比较分析3种代谢紊乱相关脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型与不同阶段MASH人类患者的转录谱异同,探究更适合模拟人类疾病进展的小鼠模型。方法 40只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为对照的普通饮食(NCD)组以及构造MASH模型的高脂高胆固醇饮食(HFHCD)、胆碱缺乏高脂饮食(CDHFD)、蛋氨酸-胆碱缺乏饮食(MCD)组,每组10只。造模结束后,每组取3只小鼠进行肝脏mRNA-seq转录组测序,同时检索MASH患者的肝脏mRNA公共数据集,通过KEGG集富集分析比较不同小鼠模型和MASH患者的转录图谱,利用Pearson相关性分析探究各种模型与人类MASH之间差异基因表达的相关性。结果 3种MASH小鼠模型中,检测到7个共同的上调基因(Col1a1、Smoc2、Col6a1、Gpx3、Col16a1、Spp1和Crtap)。KEGG分析中,3种MASH小鼠模型富集到28条重叠通路,涉及脂肪变性、肝细胞损伤和纤维化等方面,其中HFHCD和MCD两种模型的重叠程度更高。比较不同小鼠模型和MASH不同阶段患者之间的差异基因表达和代谢通路,显示3种MASH小鼠模型的变化与人类MASH的纤维化进展阶段更为相似。其中,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。结论 3种MASH小鼠模型转录谱之间存在一定异同,MASH小鼠模型与人类患者MASH进展期更相似,CDHFD模型的转录组特征与人类MASH更为接近。

关键词:代谢紊乱相关脂肪性肝炎;;小鼠模型;;转录组;;比较分析;;差异基因;;代谢通路

基金资助:国家自然科学基金项目(编号:92268109)~~