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作者:安尉;李春晓;王艺霏;王振龙;田欣雅;韩冰;陶慧;王金全;王秀敏;
单位:农业农村部饲料生物技术重点实验室/中国农业科学院饲料研究所;南京农业大学动物科技学院;
摘要:近期研究发现,14.5%的猫过敏患者血清中存在针对新型猫过敏原蛋白——尼曼匹克C2型蛋白(Niemann-Pick type C2,NPC2)的高特异性免疫球蛋白E(IgE)。为了深入解析该蛋白的致敏机制,并开发高效、精准的多表位疫苗,本研究针对猫的新型过敏原NPC2进行了疏水性分析、磷酸化位点预测、糖基化位点预测以及信号肽预测分析;通过NCBI数据库的蛋白质序列比对后建立猫过敏原蛋白NPC2的系统进化发育树;使用SOPMA软件对NPC2蛋白进行二级结构的预测分析,利用Swiss-Model进行了3D结构的同源建模,并与犬过敏原蛋白Can f7的抗原表位进行了比较。结果:猫过敏原蛋白NPC2与美洲狮NPC2蛋白的序列同源率最高,达到99.33%;猫过敏原蛋白NPC2的B细胞线性抗原表位序列为~(85)FPIPEADGCKSG~(96)、~(22)VIFKDCG~(28)、~(100)PIQQGKTYSY~(109)、~(65)VSSQG~(69)、~(132)GDKEQ~(136)和~(115)VKNEYPS~(121),T细胞表位为~(26)DCGSGFGVI~(34)、~(129)QLLGDKEQN~(137)、~6VAFVLLALSASGLAE~(20)、~(71)KALVYGILMGVAVPF~(85)和~(116)KNEYPSIKVMVKWQL~(130);猫过敏原蛋白NPC2的构象性表位主要位于无规卷曲区域;此外,猫过敏原蛋白NPC2与犬过敏原蛋白Can f7的抗原表位序列具有一定的相似性,可能具有免疫交叉反应性和交叉保护性。综上,本研究通过生物信息分析获得了猫过敏原蛋白NPC2的B细胞、T细胞优势抗原表位,其结果可为宠物过敏原蛋白的多表位疫苗研究提供理论基础,并为对猫过敏的免疫治疗提供新的干预靶点和策略。
关键词:猫过敏原;;生物信息学;;抗原表位预测
基金资助:中国农业科学院饲料研究所科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-2023-IFR-14)