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畜牧与兽医2025年第07期:福州市某规模化猪场3种腹泻病毒流行情况调查及猪流行性腹泻病毒S基因序列遗传变异分析

来源:期刊VIP网 时间:


作者:郭桂兰;王凯莉;王鑫鑫;郭桂杰;

单位:福建农林大学动物科学学院;

摘要:为了解福建地区致猪腹泻病病毒的流行现状和猪流行性腹泻病毒(PEDV)的变异情况,2023—2024年从福州市某疑似感染腹泻病毒的规模化猪场采集发病仔猪样品,经RT-PCR进行PEDV、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)核酸检测,并对PEDV阳性病料进行纤突蛋白(S)基因序列扩增和测序,进行遗传演化分析。结果:PEDV、TGEV和PoRV检出率分别为32.29%(31/96)、30.21%(29/96)和4.17%(4/96),其中PEDV和TGEV混合感染17份(17.71%),TGEV和PoRV混合感染1份(1.04%),PEDV、TGEV和PoRV三重混合感染1份(1.04%)。从10份PEDV阳性猪肠道组织样品中获得10株PEDV的S基因序列,全长3 753~4 179 bp,编码1 250~1 392 aa, 10株PEDV的S基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为94.9%~99.8%和83.8%~99.7%。S基因系统发育进化树结果表明,6株属于GⅠb亚型,4株属于GⅡb亚型,且4株PEDV的S基因为独立的一小分支。与经典毒株CV777的S基因序列相比,10株PEDV的S基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为93.6%~96.9%和83.9%~95.9%,存在23个保守氨基酸位点突变,在162 aa处缺失1个氨基酸(R),GⅠb亚型的6株PEDV S蛋白存在10个保守氨基酸位点突变;GⅡb亚型的4株PEDV S蛋白存在45个保守氨基酸位点突变,在59~62 aa处有4个氨基酸(QGVN)插入,163 aa处缺失1个氨基酸(D)。综上,福建某规模化猪场PEDV流行率较高,流行毒株基因型呈现多样性,说明流行株持续变异,临床上应予以高度重视。

关键词:猪流行性腹泻病毒;;猪轮状病毒;;猪传染性胃肠炎病毒;;鉴定;;序列分析;;福州

基金资助:福建省自然科学基金面上项目(2024J01388)