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作者:张志豪;李建达;曹志;曾昊;任素芳;张玉玉;丁罗刚;刘飞;陈智;孙文博;于江;吴家强;
单位:青岛农业大学动物医学院;山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室/农业农村部畜禽生物组学重点实验室;
摘要:猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染可引起仔猪急性腹泻和脱水,死亡率高。为了明确山东地区PEDV的流行趋势与遗传进化情况,本研究于2022—2023年对山东省的13个地级市进行了流行病学调查。通过对PEDV N基因的RT-PCR检测,结果在228份疑似腹泻样本中,PEDV阳性率达48.68%;同时,在PEDV感染的样本中,发现PEDV与猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)、猪轮状病毒(PoRV)共感染的现象。对PEDV阳性样本进行S1基因的扩增测序,通过MEGA6软件对PEDV阳性样本进行S1基因的遗传进化分析,发现扩增的4株流行毒株属于GⅡc型,1株流行毒株属于GⅡa型。进一步对流行毒株进行分离,通过PEDV N基因的检测和间接免疫荧光染色,证实成功分离到1株PEDV(命名为SDQD20230628)。对分离株进行S基因的遗传进化分析,发现分离株S基因与GⅡc亚型毒株同源性较近。本研究发现PEDV仍是引起山东地区猪场腹泻猪主要病毒,且呈现出GⅡc亚型毒株趋于流行的趋势,研究结果丰富了山东地区PEDV分子流行病学数据,也为PEDV感染的防控提供了理论依据。
关键词:猪流行性腹泻病毒;;流行病学调查;;病毒分离鉴定;;S基因;;遗传进化;;山东地区
基金资助:山东省重点研发计划项目(2022TZXD0041,2022CXPT010);; 山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT-08);; 山东省科技型中小企业创新能力提升工程项目(2023TSGC0849);; 济南市新高校20条项目(202333065);; 山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2023F10);; 泰山学者工程项目