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作者：段飞云;马稚强;乔黎亚;李瑞忠;杨宏林;瞿艳;赵青杉;陈晓明;
单位：大理州疾病预防控制中心;大理白族自治州人民医院;大理州永平县疾病预防控制中心;
摘要：目的 阐明云南省大理白族自治州（大理州）2023年输入性登革1型病毒（DENV-1）全基因组序列特征。方法 收集登革热疑似病例血清样本，采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测，对阳性样本进行登革病毒全基因组捕获、文库构建与测序，通过生信分析软件得到病毒全基因组序列及基因分型，进一步通过构建进化树对全基因组序列进行同源性分析、核苷酸及氨基酸序列同源性分析、编码蛋白氨基酸位点差异分析。结果 从大理州来自西双版纳州和临沧市的登革热输入性病例血清中获得17株登革病毒全基因组序列，均属DENV-1基因I型；通过系统进化树分析，17株毒株与2023年我国广东省广州市毒株PP563875.1和2023年西双版纳州毒株PV162554.1亲缘关系最近，与2023年泰国毒株PV344274.1同源性较高；9株毒株之间的核苷酸、氨基酸同源性均值分别为99.89%～99.95%、99.72%～99.91%，与参考序列的核苷酸、氨基酸同源性均值分别为98.84%～99.92%、96.81%～99.86%；衣壳蛋白、膜前体蛋白、包膜蛋白、非结构蛋白1、非结构蛋白2A、非结构蛋白4B、非结构蛋白5蛋白氨基酸位点均存在差异，毒株Q0057W0149与2023年广州市毒株PP563875.1蛋白质氨基酸序列一致。结论 2023年大理州输入性病例的DENV-1与我国同时期广州市和西双版纳州流行株同源，与2023年、2017年和2015年泰国流行株遗传距离较近、同源性较高，提示该输入毒株可能源自泰国DENV-1流行谱系。
关键词：登革热;;登革1型病毒;;全基因组测序;;同源性分析;;氨基酸位点分析
